Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms