Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1X6

6430550D23Rik, RIKEN cDNA 6430550D23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430550D23RikE9Q1X6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
6430550D23RikE9Q1X6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
6430550D23RikE9Q1X6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms