Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc171E9Q1U1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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