Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
4930426L09RikE9Q0N7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930426L09RikE9Q0N7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms