Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fndc1E9Q043 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms