Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931408C20RikE9PWP9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms