Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms