Protein–RNA interactions for Protein: E9PV04

Gm8994, Predicted gene 8994, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8994E9PV04 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8994E9PV04 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms