Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms