Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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