Protein–RNA interactions for Protein: D3YYH9

Gm498, Predicted gene 498, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm498D3YYH9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm498D3YYH9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm498D3YYH9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms