Protein–RNA interactions for Protein: D3YYB5

Gm42791, Predicted gene 42791 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42791D3YYB5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm42791D3YYB5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms