Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms