Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc170D3YXL0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms