Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rexo5D3YW29 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms