Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smok3bC0HKC9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms