Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptprz1B9EKR1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms