Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nxpe3B9EKK6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms