Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmf1B9EKI3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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