Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cttnbp2B9EJA2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cttnbp2B9EJA2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms