Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms