Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phf11bB4XVQ1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf11bB4XVQ1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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