Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms