Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfia1B2RXQ2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia1B2RXQ2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms