Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cped1B2RX70 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms