Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Siah3B2RWG3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms