Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Abcc8B2RUS7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Abcc8B2RUS7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Abcc8B2RUS7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms