Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apba1B2RUJ5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms