Protein–RNA interactions for Protein: B2RUD9

Gm4787, MCG140564, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4787B2RUD9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4787B2RUD9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4787B2RUD9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4787B2RUD9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4787B2RUD9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4787B2RUD9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4787B2RUD9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4787B2RUD9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4787B2RUD9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4787B2RUD9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4787B2RUD9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4787B2RUD9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4787B2RUD9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4787B2RUD9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4787B2RUD9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4787B2RUD9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4787B2RUD9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4787B2RUD9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4787B2RUD9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm4787B2RUD9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms