Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms