Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zscan5bB2RTN3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms