Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc22a28B2RT89 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc22a28B2RT89 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc22a28B2RT89 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc22a28B2RT89 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc22a28B2RT89 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc22a28B2RT89 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc22a28B2RT89 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc22a28B2RT89 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms