Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apol7aB2RT54 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apol7aB2RT54 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apol7aB2RT54 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apol7aB2RT54 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apol7aB2RT54 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apol7aB2RT54 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Apol7aB2RT54 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apol7aB2RT54 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apol7aB2RT54 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apol7aB2RT54 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apol7aB2RT54 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apol7aB2RT54 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apol7aB2RT54 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apol7aB2RT54 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apol7aB2RT54 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apol7aB2RT54 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apol7aB2RT54 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apol7aB2RT54 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms