Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf3B2RQG2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms