Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms