Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf3B2KF05 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms