Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H60cB1B213 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H60cB1B213 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H60cB1B213 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H60cB1B213 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H60cB1B213 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms