Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn7aB1AYL1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn7aB1AYL1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms