Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3aB1AWZ3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms