Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NhsB1AV60 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms