Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Trabd2bB1ATG9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Trabd2bB1ATG9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Trabd2bB1ATG9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trabd2bB1ATG9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trabd2bB1ATG9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trabd2bB1ATG9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trabd2bB1ATG9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trabd2bB1ATG9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trabd2bB1ATG9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trabd2bB1ATG9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trabd2bB1ATG9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trabd2bB1ATG9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trabd2bB1ATG9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trabd2bB1ATG9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trabd2bB1ATG9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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