Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spocd1B1ASB6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms