Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatsperbA2RTF1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms