Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms