Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Patl2A2ARM1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Patl2A2ARM1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms