Protein–RNA interactions for Protein: A2ALV5

AI481877, Expressed sequence AI481877, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AI481877A2ALV5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AI481877A2ALV5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
AI481877A2ALV5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AI481877A2ALV5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
AI481877A2ALV5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AI481877A2ALV5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
AI481877A2ALV5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AI481877A2ALV5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AI481877A2ALV5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AI481877A2ALV5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AI481877A2ALV5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AI481877A2ALV5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AI481877A2ALV5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AI481877A2ALV5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AI481877A2ALV5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AI481877A2ALV5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AI481877A2ALV5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AI481877A2ALV5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AI481877A2ALV5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms