Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms