Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Frmpd1A2AKB4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Frmpd1A2AKB4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Frmpd1A2AKB4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms