Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VirmaA2AIV2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VirmaA2AIV2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VirmaA2AIV2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VirmaA2AIV2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VirmaA2AIV2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VirmaA2AIV2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VirmaA2AIV2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
VirmaA2AIV2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
VirmaA2AIV2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
VirmaA2AIV2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VirmaA2AIV2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
VirmaA2AIV2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms