Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms